O Departamento de Fonoaudiologia possui docentes vinculados aos seguintes Programas de Pós-graduação:
Stricto Sensu:
- Programa de Pós-graduação em Ciências da Reabilitação (IMRS/UFBA) https://ppgreab.ufba.br/
- Programa de Pós-graduação em Saúde, Ambiente e Trabalho (FAMEB/UFBA)
- Programa de Pós-graduação em Educação (FACED/UFBA)
http://www.pgedu.faced.ufba.br/pt-br
- Programa de Pós-graduação em Processos Interativos de Órgãos e Sistemas (ICS/UFBA) https://www.ppgorgsistem.ics.ufba.br/
- Programa de Pós-graduação em Medicina e Saúde (FAMEB/UFBA)
-Mestrado Profissional em Saúde Coletiva (UNEB)
Latu Sensu:
- Programa de Residência Integrada Multiprofissional em Saúde Mental (HUPES/UFBA)
- Programa de Residência Integrada Multiprofissional em Saúde da Criança (HUPES/UFBA)
- Programa de Residência Integrada Multiprofissional em Saúde do Adulto (HUPES/UFBA)
- Residência Multiprofissional em Saúde Coletiva com concentração em Planejamento e Gestão (ISC/UFBA)
http://www.isc.ufba.br/residencias/planejamento-e-gestao/
- Residência Multiprofissional em Saúde Coletiva com ênfase na Primeira Infância no contexto da Zica Vírus (ISC/UFBA)